В лицее функционирует пищеблок на 96 посадочных мест, оснащенный необходимым технологическим оборудованием. В 2010 году в рамках комплексного проекта модернизации образования была модернизирована школьная столовая: установлено новое современное оборудование, учащиеся получают полноценное горячее питание. Примерное недельное меню составлено оператором комбината школьного питания, согласовано с директором лицея и представлено на информационном стенде. В столовый лицея можно получить организованное горячее питание (горячий завтрак, горячий обед) или приобрести буфетную продукцию.
Бесплатное горячее питание предоставляется всем ученикам с 1 по 4 класс.
Обучающиеся с ограниченными возможностями здоровья получают двухразовое питание.
Обучающиеся с ограниченными возможностями здоровья, находящиеся на индивидуальном обучении на дому, получают продуктовый набор.
В МБОУ «Лицей №86» нет специальных условий питания для инвалидов и лиц с ограниченными возможностям здоровья.